深圳海關針對開展金關工程二期業務的特殊監管區域及保稅監管場所企業，提供了詳細的接入指南。企業可以根據自身業務需求，選擇手工錄入或數據交換的方式進行申報。以下是具體的操作指引：

一、手工錄入申報方式

1. 下載安裝客戶端：企業需訪問深圳海關數據分中心門戶網站（http://www.szcport.cn），在“資料/程序下載”欄目中下載并安裝“海關特殊監管區域管理系統（深圳海關）客戶端及操作手冊”。

2. 申請注冊碼：在完成客戶端的安裝后，企業需在同一門戶網站的“插卡登錄網上辦理”欄目中，提交“海關特殊監管區域管理系統（深圳海關）開通申請”，以獲取注冊碼并進行注冊使用。

二、數據交換方式

1. 安裝數據交換客戶端：企業可下載并安裝“深關通”數據交換客戶端，該客戶端同樣可在深圳海關數據分中心門戶網站的“資料/程序下載”欄目中找到。若企業選擇不使用“深關通”客戶端，則可以選擇其他符合海關總署要求的數據交換客戶端。

2. 申請業務數據交換接口：企業需通過門戶網站提交“深關通”客戶端業務數據交換接口的申請。若使用其他數據交換客戶端，則需按照海關總署公告2016年第16號、2017年第20號的要求進行接口申請。

3. 報文生成：企業需根據金關二期導入接口規范生成相應的報文。這些規范可以在門戶網站中的“公告/通知”欄目下，關于“深關通”數據交換客戶端的通知附件中找到。

4. 測試環境報文預檢：企業應將準備好的報文放入金關二期報文校驗輔助工具中進行檢測，確保報文格式正確、數據完整。

5. 正式環境報文驗證：企業收到上線運行配置信息后，需根據企業類型（如物流賬冊或加工賬冊）在正式環境中進行報文驗證。驗證順序包括賬冊信息、核注清單與核放單、業務申報表及其他相關單據等。

6. 正常使用：完成以上步驟并驗證無誤后，企業即可開始正常使用金關二期系統進行業務申報和數據處理。

此指南旨在幫助企業順利接入金關二期系統，確保特殊監管區域及保稅監管場所的業務能夠高效、準確地進行申報和處理。企業應嚴格按照指南要求進行操作，以確保數據的準確性和系統的穩定性。